Giriş
Multipleks PCR teknolojisi, hastalık etkenlerinin belirlenmesinde yeni bir teknolojidir. Avantajı, birden çok hastalık etkeninin tek çalışmada ortaya konulabilmesi, sistemin hassas olması, kültür üzere antibiyotiklerden etkilenmemesi ve birebir devirde da süratli sonuç alınabilmesidir. Tüm bu nedenlerle, yerkürede bu teknoloji giderek artan nispette tanı yerinde kullanılmaya başlanmıştır.
Formül
Laboratuvarımızda** bu sistem, iki yıldan beri kullanılmaktadır. Bu emelle, dışkı örneklerinin incelenmesinde PathoFinder (Hollanda) firmasının CE onaylı Multipleks PCR kiti kullanılmaktadır. Bu kit ile 9 bakteri, 4 protozoon ve 4 virüs olmak üzere, 17 patojen birlikte saptanabilmektedir.
Bulgular
Bu çalışmada, 2014 Eylül ile 2015 Mayıs ayları arasında laboratuvarlarımızda incelenen 162 dışkı örneği incelenmiştir. Bu örneklerden 51 (%31.5)’i incelenen 17 etken tarafından negatif, 111 (%68.5)’i ise müspet bulunmuştur. 111 müspet örnekte, yekunda 119 patojen saptanmıştır. 8 hastada, birden çokça patojen bulunmuştur.
Bulunan 119 patojenden 95 (%79.8)’i bakteri, 16 (%13.5)’sı virüs ve 8 (%6.7)’i de protozoondur.
Bakteriyel Etkenler: 62 hasta örneğinden 68 (%42)’inde Salmonella sp., 13 (%8)’ünde Clostridium difficile toksin A/B, 7 (% 4.3)’sinde Shiga toksin oluşturan E.coli
( STEC), 2 (% 1.2)’sinde Campylobacter jejuni, 1’inde Campylobacter sp., 1’inde Aeromonas sp., 1’inde Shigella sp., 1’inde de Yersinia enterocolitica saptanmıştır.
Viral Etkenler: 162 dışkı örneğinden 12 (%7.4)’sinde Nörovirus, 2(%1.2)’sinde Astrovirus, 1’inde Rotavirus ve 1’inde de Adenovirus saptanmıştır.
Protozoal Etkenler: 162 dışkı örneğinden 3 (%1.85)’ünde Giardia lamblia, 4(%2.47)’ünde Dientamoeba fragilis ve 1’inde de Crytosporidium sp. saptanmıştır.
Tartışma ve Sonuç
Multipleks PCR teknolojisinin, gastrointestinal patojenlerin saptanmasında epey verimli ve başarılı bir prosedür olduğu görülmektedir. 162 dışkı örneğinden, 111 (% 68.5)’inde müspetlik saptanması bunu ortaya koymaktadır. Kültür ve gayrı inceleme metotlarıyla bu nispette bir müspetlik yakalamak neredeyse olanaksızdır.
Başkaca, bu kadar farklı ve çeşitli patojenin tek bir çalışmada ve çok süratli olarak
(1 günden az sürede) ortaya konulması, hem tanıda süratlilik sağlamakta, hem de hasta maliyetlerini önemli orantıda azaltmaktadır.
Alınan sonuçlar, bugüne kadar var olan haberlerimizi de değişikliğe uğratacak niteliktedir. Şöyle ki:
Bakteriler içinde Salmonella sp.’nin net bir üstünlüğü görülmektedir. Clostridium difficile toksin A/B’nin de azımsanmayacak orantıda bulunduğu görülmektedir (13 olgu, %8). Ayrıyeten, STEC de değerli bir nispet oluşturmaktadır. Campylobacter jejuni de tanıda düşünülmelidir.
Virüsler içinde, ekseriyetle tanıda Rotavirus ve Adenovirus aranmaktadır. Halbuki, bu yolla Nörovirus’un 12 olguyla (%7.4) önde olduğu ve Astrovirus’un 2. sırada olduğu görülmektedir.
Protozoonlar içinde de Giardia lamblia ( 3 olgu, %1.85) ve Dientamoeba fragilis (4 olgu, %2.47) önde görünmektedir. 1 hastada da Cryptosporidium sp. saptanmıştır.
Multipleks PCR yolunun, gastrointestinal patojenlerin incelenmesinde geniş etken spektrumu olan, süratli, ekonomik ve başarılı bir metot olarak rahatlıkla kullanılabileceği ve bu maksatla kullanılan prosedürler içinde giderek en çok kullanılacak tanı yolu olacağı görüşüne varılmıştır.
**Gelişim Tıp Laboratuvarları
01/06/2015
Prof. Dr. Paşa Göktaş
İnfeksiyon Marazları ve Klinik Mikrobiyoloji Eksperi
Multipleks PCR teknolojisi, hastalık etkenlerinin belirlenmesinde yeni bir teknolojidir. Avantajı, birden çok hastalık etkeninin tek çalışmada ortaya konulabilmesi, sistemin hassas olması, kültür üzere antibiyotiklerden etkilenmemesi ve birebir devirde da süratli sonuç alınabilmesidir. Tüm bu nedenlerle, yerkürede bu teknoloji giderek artan nispette tanı yerinde kullanılmaya başlanmıştır.
Formül
Laboratuvarımızda** bu sistem, iki yıldan beri kullanılmaktadır. Bu emelle, dışkı örneklerinin incelenmesinde PathoFinder (Hollanda) firmasının CE onaylı Multipleks PCR kiti kullanılmaktadır. Bu kit ile 9 bakteri, 4 protozoon ve 4 virüs olmak üzere, 17 patojen birlikte saptanabilmektedir.
Bulgular
Bu çalışmada, 2014 Eylül ile 2015 Mayıs ayları arasında laboratuvarlarımızda incelenen 162 dışkı örneği incelenmiştir. Bu örneklerden 51 (%31.5)’i incelenen 17 etken tarafından negatif, 111 (%68.5)’i ise müspet bulunmuştur. 111 müspet örnekte, yekunda 119 patojen saptanmıştır. 8 hastada, birden çokça patojen bulunmuştur.
Bulunan 119 patojenden 95 (%79.8)’i bakteri, 16 (%13.5)’sı virüs ve 8 (%6.7)’i de protozoondur.
Bakteriyel Etkenler: 62 hasta örneğinden 68 (%42)’inde Salmonella sp., 13 (%8)’ünde Clostridium difficile toksin A/B, 7 (% 4.3)’sinde Shiga toksin oluşturan E.coli
( STEC), 2 (% 1.2)’sinde Campylobacter jejuni, 1’inde Campylobacter sp., 1’inde Aeromonas sp., 1’inde Shigella sp., 1’inde de Yersinia enterocolitica saptanmıştır.
Viral Etkenler: 162 dışkı örneğinden 12 (%7.4)’sinde Nörovirus, 2(%1.2)’sinde Astrovirus, 1’inde Rotavirus ve 1’inde de Adenovirus saptanmıştır.
Protozoal Etkenler: 162 dışkı örneğinden 3 (%1.85)’ünde Giardia lamblia, 4(%2.47)’ünde Dientamoeba fragilis ve 1’inde de Crytosporidium sp. saptanmıştır.
Tartışma ve Sonuç
Multipleks PCR teknolojisinin, gastrointestinal patojenlerin saptanmasında epey verimli ve başarılı bir prosedür olduğu görülmektedir. 162 dışkı örneğinden, 111 (% 68.5)’inde müspetlik saptanması bunu ortaya koymaktadır. Kültür ve gayrı inceleme metotlarıyla bu nispette bir müspetlik yakalamak neredeyse olanaksızdır.
Başkaca, bu kadar farklı ve çeşitli patojenin tek bir çalışmada ve çok süratli olarak
(1 günden az sürede) ortaya konulması, hem tanıda süratlilik sağlamakta, hem de hasta maliyetlerini önemli orantıda azaltmaktadır.
Alınan sonuçlar, bugüne kadar var olan haberlerimizi de değişikliğe uğratacak niteliktedir. Şöyle ki:
Bakteriler içinde Salmonella sp.’nin net bir üstünlüğü görülmektedir. Clostridium difficile toksin A/B’nin de azımsanmayacak orantıda bulunduğu görülmektedir (13 olgu, %8). Ayrıyeten, STEC de değerli bir nispet oluşturmaktadır. Campylobacter jejuni de tanıda düşünülmelidir.
Virüsler içinde, ekseriyetle tanıda Rotavirus ve Adenovirus aranmaktadır. Halbuki, bu yolla Nörovirus’un 12 olguyla (%7.4) önde olduğu ve Astrovirus’un 2. sırada olduğu görülmektedir.
Protozoonlar içinde de Giardia lamblia ( 3 olgu, %1.85) ve Dientamoeba fragilis (4 olgu, %2.47) önde görünmektedir. 1 hastada da Cryptosporidium sp. saptanmıştır.
Multipleks PCR yolunun, gastrointestinal patojenlerin incelenmesinde geniş etken spektrumu olan, süratli, ekonomik ve başarılı bir metot olarak rahatlıkla kullanılabileceği ve bu maksatla kullanılan prosedürler içinde giderek en çok kullanılacak tanı yolu olacağı görüşüne varılmıştır.
**Gelişim Tıp Laboratuvarları
01/06/2015
Prof. Dr. Paşa Göktaş
İnfeksiyon Marazları ve Klinik Mikrobiyoloji Eksperi